空间蛋白组学（Spatial Proteomics）是一种结合蛋白质表达信息与其空间定位的前沿技术，能够揭示蛋白质在组织、细胞乃至亚细胞水平的分布特征。它在癌症、神经退行性疾病、免疫研究等领域有着广泛的应用价值。

一、样本准备：组织切片是关键起点

空间蛋白组学通常以冰冻或石蜡包埋的组织切片为起始材料。样本准备环节需兼顾两个关键因素：

• 组织结构的空间完整性：确保切片形态清晰、组织结构未被破坏。
• 蛋白质抗原性的保持：尤其在免疫染色或抗体依赖型技术中尤为重要。

为了避免蛋白降解，样本需低温保存，处理过程也需严格控制时间和温度。

二、目标区域识别与标记：精确定义空间坐标

在进行蛋白质检测前，需通过病理染色（如H&E染色）、免疫荧光或荧光原位杂交（FISH）等手段，定位感兴趣的细胞群体或病理区域。

目前主流的定位技术包括：

• 激光微切割 (Laser Capture Microdissection, LCM)：适用于精准分离特定细胞或区域。
• 显微图像配准系统：在空间组学平台中实现蛋白定位与图像匹配。

百泰派克生物科技拥有先进的组织影像识别系统，可实现亚细胞水平的目标区域精确识别，大幅提升空间分辨率。

三、蛋白质检测与数据获取：多技术融合

空间蛋白组学并非一种单一技术，而是由多种检测平台构建而成，常见的包括：

1、Imaging Mass Cytometry（IMC）

结合质谱与抗体标记，能同时检测40+蛋白靶点，空间分辨率高，适合免疫微环境研究。

2、Multiplexed Ion Beam Imaging（MIBI）

采用离子束撞击释放二次离子并质谱检测，同样支持多蛋白检测，背景信号低。

3、CODEX（Co-detection by Indexing）

基于荧光成像，通过循环荧光标记和图像采集，实现数十种蛋白同步可视化。

4、Nano-DESI / MALDI Imaging MS

无需抗体，直接分析组织中蛋白或肽段分布，适用于发现未知标志物。

百泰派克生物科技提供包括IMC、MALDI-MS成像等多平台空间蛋白组学服务，兼顾高通量与高分辨率需求。

四、数据预处理与定量分析

原始数据获取后，需进行严格的数据预处理，包括：

• 图像校准与背景去除
• 信号强度归一化
• 蛋白表达的空间可视化与定量提取

在MALDI-MS等平台中，还需进行质谱峰识别与配对，以匹配具体蛋白或肽段。

五、生物信息学分析：空间异质性的深度解析

这是空间蛋白组学中最具价值的一步，主要包括：

• 空间聚类分析（Spatial Clustering）：识别组织中的功能区域。
• 细胞通讯分析（Cell–Cell Interaction）：揭示细胞间信号网络。
• 空间关联性分析（Spatial Correlation）：例如蛋白A和B在空间上的共定位趋势。
• 免疫图谱构建：分析免疫细胞浸润分布，评估免疫微环境状态。

随着AI技术的引入，越来越多研究采用深度学习算法识别蛋白分布模式，挖掘潜在的疾病亚型或预后标志物。

六、结果验证与功能研究

空间蛋白组学分析的发现，往往需要进一步验证，例如：

• 免疫组化或免疫荧光在其他样本中验证蛋白空间分布；
• Western blot 或靶向质谱验证蛋白表达趋势；
• siRNA/CRISPR功能实验验证蛋白作用机制。

百泰派克生物科技可为客户提供从空间组学发现到功能验证的全流程服务支持，助力从数据到机制的快速转化。

空间蛋白组学通过整合蛋白组学的高通量与显微成像的空间分辨能力，正在重新定义我们对疾病微环境的理解。其标准工作流程包括：

1、样本准备

2、目标区域识别

3、蛋白检测与成像

4、数据预处理与定量

5、空间生信分析

6、结果验证与功能研究

随着成像质谱、多重标记技术和AI算法的融合，空间蛋白组学正逐渐走向精准医学和转化研究的前沿。如果您正在开展肿瘤微环境、神经退行性疾病或组织发育研究，欢迎联系百泰派克生物科技，获取定制化的空间蛋白组学解决方案，开启“看得见的蛋白组学”新时代。

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百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

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