TMT定量蛋白质组学技术的优缺点
产品名称: TMT定量蛋白质组学技术的优缺点
英文名称: Advantages and Disadvantages of TMT-based Quantitative Proteomics
产品编号: tmt-quantitative-proteomics-zh20
产品价格: 询价
产品产地: 中国北京
品牌商标: 百泰派克生物科技
更新时间: 2025-10-24T11:03:41
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TMT定量蛋白质组学因出色的多通道定量能力和稳定的定量重现性,广泛应用于生物标志物筛选、疾病机制研究、药物作用分析等多个生命科学研究领域。TMT 与 iTRAQ 类似,均为基于质谱的等质量同位素标签技术,但在灵敏度、抗干扰能力和平台适配方面展现出不同的技术特点。
TMT技术通过对不同样本中的肽段进行化学等质量标记,在质谱MS/MS阶段释放不同质量的“报告离子”,实现多样本并行定量。
工作流程:
1、样本蛋白提取与酶解;
2、不同TMT标签对样本肽段进行标记(常见如TMT 6plex、10plex、11plex、16plex、18plex);
3、标记后混合所有样本;
4、LC-MS/MS 分析,在二级质谱中识别出不同标签对应的报告离子强度;
5、报告离子强度反映不同样本中目标肽段的相对含量,进而回推至蛋白层面定量。
TMT标签设计确保标记肽段在一级质谱中等质量表现,在二级质谱碎裂时释放出具有质量差异的reporter离子(例如126–131、或126–134 Da),用于定量。
二、TMT定量蛋白质组学的优势
1、高通量样本并行能力
TMT最多可支持18通道并行分析(TMTpro 18plex),显著提升实验效率和组间比较精度,特别适用于时间序列、多分组、多重复设计的课题。百泰派克生物科技基于 TMTpro 18plex 提供多组样本一体化处理方案,有效降低批次间误差,提高数据可比性。
TMT定量在MS2级别易受共碎裂干扰(Ratio compression),但TMT配套 Thermo 的Orbitrap Fusion Lumos 等平台支持SPS-MS3 模式(Synchronous Precursor Selection),可显著降低比值压缩问题,提高定量精度。相比iTRAQ,TMT具备更完整的MS3支持方案,更适合高精度定量要求的实验设计。
3、定量重复性高
TMT采用样本标记后混合、统一LC-MS分析的方式,避免了批次差异和进样不一致问题,显著提高了数据一致性和定量重复性。
4、灵敏度高,适用复杂样本
结合高分辨率质谱和纳流液相系统,TMT可实现对复杂生物样本(如血清、组织、细胞系)中中低丰度蛋白的稳定检测与定量,广泛适用于肿瘤、免疫、神经等疾病研究。
三、TMT定量蛋白质组学的缺点
1、Ratio Compression 问题(比值压缩)
在MS2定量中,目标肽段常与背景肽段共碎裂,导致报告离子混杂,真实表达差异被低估。尤其在高复杂度样本中,此现象更为严重。
解决策略:
(1)使用高分辨率Orbitrap Fusion Lumos质谱;
(2)启用 SPS-MS3 模式;
(3)优化肽段前处理与分级策略,减少共碎裂。
2、设备平台依赖性强
TMT对质谱平台要求较高(通常为 Thermo Orbitrap 系列支持度最佳),在非Orbitrap平台上实施困难,限制部分实验室独立开展。
3、标记试剂成本较高
TMT标签价格相对昂贵,尤其在大规模项目(如18通道重复设计)中,整体实验预算相对较高。因此需合理规划样本数量与分组策略,以确保投入产出比zuì yōu化。
4、翻译后修饰研究需结合PTM富集
TMT定量标记发生在肽段层面,不保留蛋白结构层面信息。如需研究磷酸化、乙酰化等翻译后修饰(PTM),仍需结合专门的修饰位点富集策略(如TiO₂富集)。百泰派克生物科技支持TMT + PTM联合分析服务,适配肽段标记与修饰位点追踪的技术需求。
四、TMT定量蛋白质组学适用场景

五、百泰派克生物科技:TMT技术一站式解决方案
百泰派克生物科技提供完整的TMT蛋白质组学技术服务,覆盖:
- TMT 6plex/10plex/16plex/18plex多通道标签选择
- 样本分组设计与实验规划支持
- Orbitrap Fusion Lumos质谱系统,支持MS2与SPS-MS3模式
- 高质量生信分析,包括差异蛋白筛选、富集分析、PPI网络构建等
- 多组学(代谢组/转录组)联合分析服务
我们通过标准化流程与灵活定制服务,助力科研人员以zuì yōu性价比获取高质量、可发表的TMT定量蛋白质组学数据。
TMT技术具有多通道定量能力、较强的数据一致性和较高的抗干扰能力。尽管其成本和平台依赖性需考量,但对于追求数据深度、组间一致性与高精度的科研项目,TMT仍是不可替代的强有力工具。 如您计划开展TMT蛋白质组学项目,或对比TMT/iTRAQ/Label-free等策略的选型有疑问,欢迎联系百泰派克生物科技技术团队,我们将为您定制最合适的实验解决方案。
百泰派克生物科技特色项目
一、蛋白测序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。
※服务优势:
1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;
3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;
4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;
5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug,即可完成检测;
6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。
二、蛋白质组学
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。
※服务优势:
1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;
2.体内体外多种蛋白质标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;
3.质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;
4.可检测较低丰度蛋白,线性范围广;
5.专业生物信息学分析,分析更系统准确。
三、单细胞质谱流式技术分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,然后用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。
※服务优势:
1.技术先进,填补技术空白
采用金属标记抗体技术,避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征,百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。
2.分析数量大,成本较低
单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。
3.应用前景大
①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;
②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;
③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现
百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。
五、生物药物表征
百泰派克基于高分辨率质谱技术,MALDI TOF,高效色谱分离技术,提供一系列完善的生物药物分析方案,从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析,到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务,帮助生物医药生产商提高生物药物品质。
百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。
1.公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;
2.获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;
3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;
4.七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;
5.服务3000+企业,10000+客户的选择;
6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!
